MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 127469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002944	CGC	2	6	221493	221498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406313
5502	NC_002944	ACCT	2	8	221524	221531	25 %	25 %	0 %	50 %	41406313
5503	NC_002944	TGC	2	6	221573	221578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5504	NC_002944	TGC	2	6	221582	221587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5505	NC_002944	TGC	2	6	221594	221599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5506	NC_002944	GGC	2	6	221601	221606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406313
5507	NC_002944	CGCC	2	8	221607	221614	0 %	0 %	25 %	75 %	41406313
5508	NC_002944	GGC	2	6	221615	221620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406313
5509	NC_002944	CGT	2	6	221621	221626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5510	NC_002944	CGG	2	6	221687	221692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406313
5511	NC_002944	TGG	2	6	221693	221698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406313
5512	NC_002944	CTG	2	6	221719	221724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5513	NC_002944	TGC	2	6	221774	221779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5514	NC_002944	CTGC	2	8	221793	221800	0 %	25 %	25 %	50 %	41406313
5515	NC_002944	CGT	2	6	221814	221819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5516	NC_002944	ACT	2	6	221846	221851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406313
5517	NC_002944	GC	3	6	221888	221893	0 %	0 %	50 %	50 %	41406313
5518	NC_002944	GGC	2	6	221925	221930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406313
5519	NC_002944	CGA	2	6	221949	221954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5520	NC_002944	CACG	2	8	221958	221965	25 %	0 %	25 %	50 %	41406313
5521	NC_002944	TCG	2	6	221981	221986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5522	NC_002944	CGC	2	6	221992	221997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406313
5523	NC_002944	CCG	3	9	222035	222043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406313
5524	NC_002944	GCC	2	6	222067	222072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406313
5525	NC_002944	AAC	2	6	222088	222093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406313
5526	NC_002944	GC	3	6	222104	222109	0 %	0 %	50 %	50 %	41406313
5527	NC_002944	TGC	3	9	222110	222118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5528	NC_002944	GCC	3	9	222162	222170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406313
5529	NC_002944	CAC	2	6	222174	222179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406313
5530	NC_002944	GCA	2	6	222204	222209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5531	NC_002944	TGG	2	6	222236	222241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406313
5532	NC_002944	GCA	2	6	222303	222308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406313
5533	NC_002944	TGCCGG	2	12	222602	222613	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	41406313
5534	NC_002944	CCG	3	9	222625	222633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406313
5535	NC_002944	CG	3	6	222632	222637	0 %	0 %	50 %	50 %	41406313
5536	NC_002944	GCG	2	6	223015	223020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406314
5537	NC_002944	GTG	2	6	223047	223052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406314
5538	NC_002944	GCG	2	6	223065	223070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406314
5539	NC_002944	CCG	2	6	223111	223116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406314
5540	NC_002944	CCG	2	6	223165	223170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406314
5541	NC_002944	GGGAC	2	10	223175	223184	20 %	0 %	60 %	20 %	41406314
5542	NC_002944	GC	4	8	223247	223254	0 %	0 %	50 %	50 %	41406314
5543	NC_002944	GAC	2	6	223257	223262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406314
5544	NC_002944	CGG	2	6	223337	223342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406314
5545	NC_002944	CAC	2	6	223397	223402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406314
5546	NC_002944	GTC	2	6	223485	223490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406314
5547	NC_002944	CTC	2	6	223508	223513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406314
5548	NC_002944	GCC	2	6	223527	223532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406314
5549	NC_002944	ACC	2	6	223534	223539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406314
5550	NC_002944	GCT	2	6	223574	223579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406314
5551	NC_002944	TCG	2	6	223584	223589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406314
5552	NC_002944	GCC	2	6	223647	223652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406314
5553	NC_002944	AGG	2	6	223669	223674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406314
5554	NC_002944	AAC	2	6	223728	223733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406314
5555	NC_002944	CGGCAA	2	12	223754	223765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406314
5556	NC_002944	CGG	2	6	223862	223867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406314
5557	NC_002944	GC	3	6	223924	223929	0 %	0 %	50 %	50 %	41406314
5558	NC_002944	CCA	2	6	224005	224010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406314
5559	NC_002944	GT	3	6	224205	224210	0 %	50 %	50 %	0 %	41406315
5560	NC_002944	CTT	2	6	224216	224221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406315
5561	NC_002944	GGC	2	6	224245	224250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406315
5562	NC_002944	CGC	2	6	224275	224280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406315
5563	NC_002944	CGG	2	6	224331	224336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406315
5564	NC_002944	CGG	2	6	224371	224376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406315
5565	NC_002944	CTG	2	6	224393	224398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406315
5566	NC_002944	CGG	2	6	224464	224469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406315
5567	NC_002944	GGT	2	6	224482	224487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406315
5568	NC_002944	CGGC	2	8	224493	224500	0 %	0 %	50 %	50 %	41406315
5569	NC_002944	GCA	2	6	224538	224543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406315
5570	NC_002944	CTGG	2	8	224581	224588	0 %	25 %	50 %	25 %	41406315
5571	NC_002944	CAA	2	6	224593	224598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406315
5572	NC_002944	CGGG	2	8	224610	224617	0 %	0 %	75 %	25 %	41406315
5573	NC_002944	CGC	2	6	224620	224625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406315
5574	NC_002944	GGC	2	6	224642	224647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406315
5575	NC_002944	GCC	2	6	224666	224671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406315
5576	NC_002944	GCTTCG	2	12	224685	224696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406315
5577	NC_002944	GGCC	2	8	224755	224762	0 %	0 %	50 %	50 %	41406315
5578	NC_002944	GCA	2	6	224764	224769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406315
5579	NC_002944	CGG	2	6	224773	224778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406315
5580	NC_002944	ACGGCA	2	12	224784	224795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406315
5581	NC_002944	G	6	6	224799	224804	0 %	0 %	100 %	0 %	41406315
5582	NC_002944	GCT	2	6	224854	224859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406315
5583	NC_002944	AAC	2	6	224867	224872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406315
5584	NC_002944	GGGTGT	2	12	224877	224888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406315
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5586	NC_002944	ACG	2	6	224913	224918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406315
5587	NC_002944	GAT	2	6	224923	224928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406315
5588	NC_002944	GGCG	2	8	224935	224942	0 %	0 %	75 %	25 %	41406315
5589	NC_002944	CAG	2	6	224972	224977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406315
5590	NC_002944	GCA	2	6	224982	224987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406315
5591	NC_002944	CGG	2	6	224989	224994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406315
5592	NC_002944	CGG	3	9	225019	225027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406315
5593	NC_002944	GGCC	2	8	225049	225056	0 %	0 %	50 %	50 %	41406315
5594	NC_002944	TCG	2	6	225081	225086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406315
5595	NC_002944	CGC	2	6	225312	225317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406316
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5597	NC_002944	GTT	2	6	225339	225344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406316
5598	NC_002944	GTG	2	6	225364	225369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406316
5599	NC_002944	GCC	2	6	225387	225392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406316
5600	NC_002944	GCC	2	6	225402	225407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406316
5601	NC_002944	TGC	2	6	225413	225418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406316
5602	NC_002944	CGA	2	6	225428	225433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406316
5603	NC_002944	CGGC	2	8	225454	225461	0 %	0 %	50 %	50 %	41406316
5604	NC_002944	CCT	2	6	225473	225478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406316
5605	NC_002944	TGC	2	6	225488	225493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406316
5606	NC_002944	GAC	2	6	225532	225537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406316
5607	NC_002944	TGC	2	6	225569	225574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406316
5608	NC_002944	CCG	2	6	225607	225612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406316
5609	NC_002944	AAC	2	6	225745	225750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406316
5610	NC_002944	GAC	3	9	225850	225858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406316
5611	NC_002944	GCC	3	9	225890	225898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406316
5612	NC_002944	GC	3	6	226004	226009	0 %	0 %	50 %	50 %	41406316
5613	NC_002944	CGG	2	6	226014	226019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406316
5614	NC_002944	GC	3	6	226055	226060	0 %	0 %	50 %	50 %	41406316
5615	NC_002944	GCGCC	2	10	226076	226085	0 %	0 %	40 %	60 %	41406316
5616	NC_002944	GAG	2	6	226087	226092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406316
5617	NC_002944	CGG	2	6	226137	226142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406316
5618	NC_002944	CCA	2	6	226172	226177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406316
5619	NC_002944	GAT	2	6	226271	226276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406316
5620	NC_002944	CG	3	6	226746	226751	0 %	0 %	50 %	50 %	41406317
5621	NC_002944	GCA	2	6	226766	226771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406317
5622	NC_002944	GCCG	2	8	226854	226861	0 %	0 %	50 %	50 %	41406317
5623	NC_002944	CGGC	2	8	226904	226911	0 %	0 %	50 %	50 %	41406317
5624	NC_002944	CGA	2	6	226925	226930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406317
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5626	NC_002944	GCC	2	6	226965	226970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406317
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5663	NC_002944	AGCGA	2	10	228540	228549	40 %	0 %	40 %	20 %	41406318
5664	NC_002944	GAG	2	6	228554	228559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406318
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5739	NC_002944	GCCGAG	2	12	231197	231208	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	41406318
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5741	NC_002944	GCT	2	6	231268	231273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406318
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5743	NC_002944	ACG	2	6	231384	231389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406318
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5745	NC_002944	ACC	2	6	231521	231526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406318
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5861	NC_002944	CCCG	2	8	235569	235576	0 %	0 %	25 %	75 %	41406320
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5863	NC_002944	CAG	2	6	235653	235658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406320
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5988	NC_002944	TCG	2	6	239918	239923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406323
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5991	NC_002944	CCG	2	6	240115	240120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406324
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